Die von Bayer im Jahr 2007 ins Leben gerufene Bayer Science and Education Foundation verfolgt als vorrangige Ziele die Ehrung herausragender Forschungsleistungen, die Förderung wissenschaftlicher Talente und die Unterstützung bedeutender schulischer Projekte. Im inhaltlichen Fokus der Fördertätigkeiten stehen die Naturwissenschaften und die Medizin.
Die parallel gegründete Bayer Cares Foundation fördert Ehrenamtsprojekte von Mitarbeitern und Bürgern. Zudem hilft sie mit Spenden Menschen, die zum Beispiel durch Naturkatastrophen in akute Not geraten sind.